Этика исследований
Последнее изменение 25 марта 2021
Рекомендации по проведению исследований на лабораторных животных/людях
В исследованиях с участием людей или человеческих биологических материалов авторы обязаны следовать рекомендациям Хельсинкской декларации 1975 года, обновлённой в 2013 году. Ссылка на декларацию должна быть приведена в соответствующем разделе методов. Согласно пункту 23 этой декларации, до проведения исследования должно быть получено одобрение этического комитета, и авторы обязаны указать код проекта, дату утверждения и название комитета по этике, выдавшего разрешение. Личная информация, идентифицирующая участников исследования, не должна приводиться, если материалы не имеют отношения к исследованию (например, фотографии лиц участников, которые показывают конкретный симптом, однако в этом случае глаза участников должны быть скрыты). Инициалы пациентов или другие личные идентификаторы не должны появляться на изображениях и/или в тексте статьи. Редакторы оставляют за собой право отклонить любые материалы, не соответствующие этим требованиям.
Для рукописей, которые включают какие-либо детали истории болезни, личную информацию и/или изображения пациентов, авторы должны получить подписанное информированное согласие от пациентов (или их родственников/опекунов) перед отправкой в СБФ. Незаполненная форма информированного согласия пациентов может быть загружена при подаче статьи. Форма согласия, разрешения или выпуска должна содержать разрешение на неограниченную публикацию в любых форматах (включая электронную, печатную или онлайн) в лицензируемых, сублицензируемых (включая переводы или деривативы) или в любых других работах под лицензией типа Open Access. СБФ оставляет за собой право попросить авторов предоставить подписанные формы согласия пациентов.
Исследования с участием животных должны проводиться в соответствии с международными признанными стандартами. Авторы должны получить предварительное одобрение этического комитета по содержанию/уходу и использованию лабораторных животных.
Название комитета по этике, а также соответствующие номера разрешений в дополнение к любым другим относящимся к делу экспериментальным деталям должны быть предоставлены при подаче статьи.
Редакционная коллегия оставляет за собой право запрашивать дополнительную информацию об экспериментах на позвоночных или высших беспозвоночных для оценки рукописи.
Мы призываем авторов соблюдать правила «Исследования на животных: отчетность об экспериментах in vivo» (ARRIVE). Рекомендации ARRIVE могут применяться в любой области биологических исследований с использованием лабораторных животных.
Клеточные линии
Авторы должны указать их источник клеточной линии, указать метод аутентификации (например, профилирование STR) и сообщить о статусе их тестирования на заражение микоплазмами. При работе авторы должны сверять список ошибочно идентифицируемых клеточных линий, поддерживаемый Международным комитетом по аутентификации клеточных линий, перед отправкой и обосновать использование любых клеточных линий, содержащихся в нем. Услуги аутентификации по клеточных линий предлагаются ATCC и другими.
Доступ к данными и программное обеспечение
СБФ требует, чтобы авторы обеспечивали доступность всех своих данных для тиражирования результатов их исследования без ограничений. Когда определенные правовые или этические ограничения запрещают публичное распространение данных, авторы должны быть готовы предоставить данные при запросе.
Доступность данных позволяет:
подтверждение, тиражирование, повторный анализ, дополнительный анализ, ре-интерпретацию или включение в метаанализы;
воспроизводимость исследования;
обеспечение архивирования данных, повышающее ценность инвестиций, вложенных в финансирование научных исследований;
облегчение поиска устаревших данных самими авторами, а также по управлению запросами на доступ к данным;
цитирование и связывание исследовательских данных и связанных с ними статей, повышение видимости и обеспечение признания авторов и кураторов.
Если ограничения доступа к данным обнаруживаются после публикации, мы оставляем за собой право опубликовать коррекцию, выразить редакторскую озабоченность, связаться с институтом авторов и их спонсорами. В крайних случаях, публикация будет отозвана.
Авторы должны предоставить оригинальные или минимально корректированные изображения, подтверждающие все результаты вестерн-блоттинга (не обрезанные), указанные на рисунках статьи и файлах дополнительной информации.
Все данные и соответствующие метаданные, лежащие в основе сообщаемых результатов, должны храниться в соответствующих общедоступных репозиториях, если они еще не предоставлены при подаче статьи. Репозитории могут быть либо предметными, принимающими определенные типы структурированных данных, либо междисциплинарными универсальными репозиториями.
Для публикации данных авторы должны выбрать репозитории, соответствующие их области исследования (например, ArrayExpress или GEO для данных микрочипов; GenBank, EMBL или DDBJ для последовательностей генов).
Авторы должны следовать принципам, разработанным PLOS, если новое программное обеспечение или новый алгоритм являются центральными для подачи заявки (например, авторы должны подтвердить, что программное обеспечение распространяется как свободный код и размещено в соответствующем общедоступном репозитории). Чтобы гарантировать, что программное обеспечение может воспроизводиться без ограничений и что авторы получают должное признание за свою работу, авторы должны лицензировать свой код с использованием лицензии с открытым исходным кодом.
Авторам рекомендуется использовать службы контроля версий, такие как GitHub, GitLab и SourceForge. Количество файлов («нетекстовые файлы», такие как изображения, zip-файлы или данные программ) по возможности должно быть сведено к минимуму, и их размер не должен превышать 50 МБ. Старайтесь избегать файлов размером более 100 МБ, так как они требуют особой обработки.
Стандарты изложения
От авторов требуется придерживаться устоявшихся стандартов изложения (см. EQUATOR, BioSharing, ARRIVE).
Для исследований, содержащих результаты рентгеноструктурного анализа, авторы должны загрузить сводный отчет о валидации из одной из баз PDB в виде дополнительных материалов для рукописи. Карты и данные координат для структуры должны быть помещены в архивированную папку и загружены как вспомогательный документ. Пожалуйста, пометьте это как «карты и данные координат для просмотра».
Также при подаче в качестве дополнительных файлов должны быть загружены:
для клинических испытаний: CONSORT;
для систематических обзоров и метаанализов: PRISMA;
для наблюдательных исследований в эпидемиологии (включая когортные, перекрестные исследования и исследования случай-контроль): STROBE;
для исследований диагностической точности: STARD.
Политика цитирования
Любые имеющиеся работы можно процитировать в списке литературы. Приемлемые источники включают:
опубликованные или принятые рукописи;
рукописи на пре-принт серверах, с учётом того, что у рукописей есть DOI или URL arXiv;
Не цитируйте следующие источники:
недоступные и неопубликованные работы, включая рукописи, которые были отправлены, но еще не приняты. Вместо этого включите эти данные в качестве дополнительных материалов или поместите данные в общедоступную базу данных;
личные комментарии (может сопровождаться письмом от автора, но не включается в список цитирования).
Ссылки должны быть перечислены в конце рукописи и пронумерованы в том порядке, в котором они появляются в тексте. В тексте укажите номер ссылки в квадратных скобках.
Прежде чем размещать ссылки, убедитесь, что части рукописи расположены в правильном порядке.
Исследовательская этика разработана на основе стандартов eLife и PLOS.