Русский

Инструкции для авторов

Последнее изменение 2 апреля 2021

Типы статей

Шаблон статьи для подачи в журнал "Системная биология и физиология" .

СБФ публикует несколько различных типов статей:

  • Оригинальные исследовательские статьи

  • Краткие сообщения

  • Обзоры литературы


Оригинальные исследовательские статьи

  • Статьи должны содержать неструктурированную аннотацию размером до 350 слов, а также от 2х до 6ти ключевых слов.

  • Статьи должны быть разделены на следующие секции: Аннотация, Введение, Методы, Результаты, Обсуждение (Результаты и Обсуждение могут быть объединены в одну секцию), Благодарности, Список использованной литературы (стиль цитирования - Elsevier Vancouver). Таблицы и рисунки должны быть расположены непосредственно в тексте. Могут быть использованы подзаголовки, однако, не более 3х уровней вложенности. По желанию авторов может быть добавлена секция заключение.

  • Статья может содержать не более 10 таблиц или рисунков. Исключения могут быть сделаны по согласованию с редактором.

  • Размеры публикуемых работ не ограничены.

  • Дополнительные материалы могут содержать необходимые данные или дополнительные рисунки/таблицы. В исключительных обстоятельствах (например, при использовании недавно разработанного метода, который требует подробного описания), расширенный раздел Методов может быть представлен как часть вспомогательной информации, но в этих случаях основная часть статьи все равно должна содержать краткие описания методов, использованных в исследовании. Дополнительные материалы не ограничены по размерам и должны быть предоставлены одновременно при подаче статьи. Дополнительные материалы, представленные после принятия статьи, будут сначала переданы редактору для утверждения, что может задержать публикацию. Дополнительные материалы будут опубликованы в том же виде, в котором они были представлены. Рекомендуется предоставлять текст (с одинарным интервалом) форматах PDF или Word; оригиналы рисунков в форматах TIF, PNG, JPG в разрешении не менее 300 dpi; таблицы данных в собственных в формате Excel; анимацию и другие движущиеся изображения или звуковые файлы в форматах AVI, MVO, MPG, WAV, QuickTime или GIF.


Краткие сообщения

  • Краткие сообщения должны быть форматированы аналогично оригинальным исследовательским статьям, однако разделы Результаты и Обсуждение должны быть объединены. Краткие сообщения должны содержать аннотацию размером не более 200 слов.

  • Размеры кратких сообщений должны составлять не более 1500 слов, исключая титульную страницу, аннотацию, список использованной литературы, рисунки, таблицы и подписи к ним.

  • Разрешено не более 4х рисунков или таблиц.


Обзоры литературы

  • СБФ публикует обзоры по запросу от редакционной коллегии, однако обзор может быть прислан и без отдельного согласования.

  • Размер обзора не должен превышать 5000 слов (включая аннотацию).

  • СБФ следует принципам Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) для систематических обзоров и мета-анализов.



Первичная подача статьи

Общие принципы форматирования названия и списка авторов

  • При подаче статьи титульный лист должен быть включён в файл рукописи статьи. Титульный лист должен содержать название рукописи, список всех авторов, контакты автора для переписки (e-mail), а также аффилиации всех авторов.

  • В дополнение к полному названию манускрипта авторы должны предоставлять короткую версию, длиной не более в 100 символов (включая пробелы).

  • Авторство статьи подразумевает значительный вклад в концептуализацию, дизайн исследования, анализ и/или интерпретацию данных, написание и коррекцию текста. Порядок авторов должен быть согласован перед подачей рукописи и любые изменения в порядке могут быть только после явного одобрения от каждого из авторов.

  • СБиФ позволяет множественное первое авторство рукописи.

  • У каждого из авторов в списке должна быть аффилиация. Аффилиация включает подразделение, университет или организацию и её локацию, включая город, область (штат, провинцию) и страну. Авторы могут указать в качестве аффилиации место, в котором они работали на момент подготовки публикации.

  • В случае если у автора есть несколько аффилиаций, необходимо указать их полный список. Авторские аффилиации будут перечислены в PDF версии статьи в том же порядке, в котором их указали авторы при подаче.

  • Как минимум один автор должен быть указан в качестве автора для переписки, который будет указан и при публикации. Роль автора для переписки также может быть передана другому соавтору.

  • Любое привлечение медицинских работников/исследователей, особенно работников фармакологической индустрии, к написанию статьи должно быть в явном виде отмечено и полностью освещено в разделе конфликт интересов. Сотрудники фармакологических компаний также должны быть отмечены в письме для главного редактора.


Вклад авторов

Вам необходимо будет указать конкретный вклад каждого из авторов при подаче вашей рукописи. Вклады авторов будут опубликованы при публикации финальной версии статьи, и они должны соответствовать реальным вкладам авторов в исследование. Подающий статью автор ответственен за заполнение данной информации при подаче статьи. Подразумевается, что каждый из соавторов ознакомился с этим списком.


Аннотация

Аннотация следует сразу же за титульным листом рукописи. Аннотация кратко представляет рукопись. Аннотация концептуально разделяется на три секции: Введение, Методы, Результаты/Заключение. В аннотации не приводятся ссылки на литературные источники. Максимальная длина аннотации 350 слов.


Введение

Секция введение должна фокусироваться на широком контексте, в котором находится рукопись. При написании введения, прежде всего, необходимо помнить о читателях, которые могут быть не погружены в сферу статьи. Добавьте краткий обзор ключевой литературы. В случае если в настоящий момент есть некоторое несогласие в области, необходимо явным образом подчеркнуть это во Введении, чтобы неопытный читатель смог более глубоко вникнуть в обсуждаемые вопросы. Введение должно быть закончено кратким заключением с описанием цели исследования и комментарием о том, была ли эта цель достигнута.


Материалы и Методы

Материалы и Методы должны содержать достаточно сведений для воспроизведения результатов рукописи. Необходимо предоставлять детальные протоколы для всех методов, как новых, так и более распространённых. Для более устоявшихся протоколов достаточно краткого описания и ссылки. Подробная информация об алгоритмах и протоколах клинических испытаний, наблюдательных исследований и других внелабораторных исследований может быть загружена в качестве дополнительной информации. Дополнительные материалы не включаются в рукопись, однако могут быть скачаны или же легко найдены на HTML версии статьи. Инструкции по форматированию дополнительной информации могут быть найдены в разделе "Инструкции по форматированию".


Результаты

Раздел результаты должен содержать подробную информацию обо всех экспериментах, которые необходимы для подтверждения выводов статьи, включая информацию о количестве повторов (если это необходимо для обеспечения воспроизводимости). В этом разделе нет определенного ограничения по количеству слов, но не следует включать детали экспериментов, которые второстепенны по отношению к основной теме статьи. Раздел может быть разделен на подразделы. Результаты должны описываться в прошедшем времени. Редакционная коллегия СБиФ настаивает на том, чтобы все данные, на основании которых делаются выводы в рукописи, могли быть предоставлены по требованию редакции. Крупные массивы данных, включающие сырые данные, могут быть расположены в соответствующих публичных репозиториях. Массивы данных меньшего размера и данные некоторых типов могут быть предоставлены в качестве дополнительной информации, сопровождающей рукопись. Авторы должны приложить все усилия, чтобы их данные были доступны для читателя, который мог бы повторно их использовать. Необходимо выбирать форматы данных, которые позволили бы их легко экспортировать.


Обсуждение

В Обсуждении должны быть изложены основные выводы и проведена интерпретация работы, должны быть пояснения важности сделанных в работе выводов. Убедитесь, что дискуссия отвечает на следующие вопросы: Каким образом выводы влияют на существующие предположения и модели в данной области? Как будущие исследования могут основываться на этих наблюдениях? Какие ключевые эксперименты необходимо провести? Обсуждение должно быть подробным и аргументированным.


Рисунки

На микрофотографиях должно быть указано исходное увеличение. У каждого рисунка должна быть соответствующая легенда. Легенды должны содержать информацию, достаточную для понимания читателем без ссылки на текст, и должны быть помещены в основной текст рукописи. Иллюстрации должны упоминаться в тексте как «Рисунок» или «Рис.» и снабжаться арабскими цифрами. Конечная ширина фигур должна составлять не менее 4х дюймов. Линии должны быть достаточной толщины, чтобы выдержать уменьшение, а буквы должны составлять 9 пунктов шрифтом Arial или эквивалентного размера. Пожалуйста, используйте изображения с разрешением не менее 300 dpi.


Таблицы

Количество таблиц должно быть сведено к минимуму. Таблицы должны содержать только важные данные и должны быть процитированы в тексте. Каждой таблице следует присвоить арабский номер. Название (легенда) таблицы должно содержать минимальные объёмы текста. Любая другая информация, такая как определения сокращений, статистика вероятностей и т.д. должна быть в сноске к таблице. Избегайте многословных, переполненных таблиц. Пустые строчки должны содержать прочерк. Таблицы должны быть представлены в формате редактируемого файла, а не в формате изображения.


Оформление списка литературы

Следует ссылаться только на статьи, тесно связанные с подаваемой рукописью. Следует избегать избыточного цитирования литературы. Желательно, чтобы авторы ссылались на оригинальные работы, а не на обзоры. Проверьте все ссылки на полноту и точность и отформатируйте ссылки в виде простого неструктурированного списка. Ссылки должны быть представлены в виде нумерованного списка в конце рукописи и с номерами в квадратных скобках [1], [3–5] в тексте. Ссылки должны быть отформатированы в стиле Elsevier Vancouver. Ссылки на личные сообщения, неопубликованные данные и рукописи, «находящиеся в стадии подготовки», должны быть вставлены, если они необходимы, только в тексте, а не в списке литературы. Публикации «в процессе публикации» следует обновлять как можно скорее. Настоятельно рекомендуется использовать программное обеспечение для отслеживания рукописей (например, EndNote, Mendeley, Zotero).


Благодарности

Лица, которые внесли существенный вклад в работу, но не соответствуют критериям авторства, должны быть перечислены в разделе благодарностей. Включение в список благодарности должно быть согласовано.


Конфликт интересов

Автор для переписки должен представить заявление о финансовых и нефинансовых конкурирующих интересах от имени всех авторов. Например, оплачиваемую работу или консультации, владение акциями, заявки на патенты, личные отношения с соответствующими лицами и членство в консультативном совете.


Сопровождающее письмо

Сопровождающее письмо должно быть загружено отдельным файлом. Максимальный размер сопровождающего письма - 1000 слов. Сопровождающее письмо должно содержать в себе ответы на следующие вопросы:

  • Какой научный вопрос лежит в основе вашей рукописи?

  • Каков ключевой вывод, который отвечает на этот вопрос?

  • Каков характер доказательств, которые вы предоставляете в поддержку своего вывода?

  • Какие три последние опубликованные статьи имеют отношение к этому вопросу?

  • Какое значение имеют ваши результаты для этой области?

  • Какое значение имеют ваши результаты для более широкого сообщества?

  • Какие еще новые открытия вы представляете?

  • Есть ли дополнительная информация, которую мы должны принять во внимание?


Вы также можете попросить исключить некоторых рецензентов. Если вы делаете так, то, пожалуйста, предоставьте пояснения.

Перед отправкой рукописи ознакомьтесь также с нашей политикой в отношении конкурирующих интересов.


Статья после рецензии

Ответ на письмо с заключением после рецензирования

Авторы должны дать ответ на письмо с решением, отвечая по пунктам.


Файл с рукописью

Файл рукописи со всеми основными таблицами в основной части должен быть загружен как файл DOCX (или DOC). Загруженный файл статьи должен включать отслеживаемые изменения с указанием внесенных исправлений, в идеале, с использованием функции отслеживания изменений в Word (если вы предпочитаете указывать текстовые изменения другим способом, например, с помощью выделения цветом, эту версию следует вместо этого загрузить как файл связанной рукописи, а чистую версию текстового файла загрузить как файл статьи). Также не забудьте включить в свою рукопись информацию, касающуюся использования клеточных линий, экспериментов на животных или людях, а также данных и доступности программного обеспечения.

 

Подача статьи 

При подаче статьи необходимо будет ввести следующую информацию:

  1. автор для переписки;

  2. сопровождающее письмо (для клинических статей, пожалуйста, кратко опишите, как эта работа может быть применима в клинической практике);

  3. название рукописи;

  4. тип статьи (информация по типам статей может быть найдена в разделе "Типы статей");

  5. тематический раздел СБФ;

  6. предлагаемые редакторы: авторам необходимо будет предложить редактора СБФ, который покажется им подходящими для оценки их работы;

  7. предлагаемые/исключаемые рецензенты: авторам рекомендуется предлагать потенциальных рецензентов для своей работы на этапе первичной подачи (в целях поддержки разнообразия, пожалуйста, подумайте о том, чтобы рекомендовать рецензентов на раннем этапе их карьеры, экспертов из групп, которые недостаточно представлены в науке; пожалуйста, не перечисляйте коллег, которые являются Вашими соратниками, сотрудниками или членами семьи; авторы также могут указать имена рецензентов или редакторов, которых они предпочли бы отстранить от рецензирования с указанием причин исключения; мы приложим все усилия, чтобы выполнить запросы авторов для исключенных лиц, если только редакторы не сочтут, что такое исключение помешает строгой оценке работы).

 

После принятия статьи

Публикация заключений рецензентов

Если мы не договорились с вами об ином, рецензии будут размещены на сервере препринтов с использованием Public Domain Dedication, что позволяет свободно использовать их повторно для любых целей. В настоящее время авторы могут отказаться от публикации препринта. В случае публикации препринта авторы самостоятельно контролируют публикацию рецензий.


СБФ - Open Access журнал: статьи распространяются на условиях Creative Commons Attribution License (если не указано иное), который разрешает неограниченное использование и распространение при условии указания автора и источника в соответствии с BOAI definition of open access.

Принятые рукописи доступны для цитирования, имеют DOI и доступны для загрузки с будущих страниц СБФ, просмотра и архивирования. Рисунки и таблицы принятой рукописи доступны в основной части PDF-файла. Дополнительные элементы, такие как видеоролики, дополнения к рисункам и файлы исходных данных, доступны для загрузки в виде отдельного zip-файла. В случае, если исследование имеет потенциально широкое общественное значение, мы рекомендуем авторам проконсультироваться с официальным представителем прессы перед публикацией.


У авторов будет 48 часов, чтобы ответить на запросы, сгенерированные в процессе вёрстки. Изменения следует ограничить незначительными исправлениями.


Исправления в опубликованных статьях

Издатели несут ответственность за исправление ошибок, обнаруженных в опубликованных статьях. Запросы на исправления или опровержения следует направлять в редакцию журнала для рассмотрения и дальнейших рекомендаций. Исправления ограничиваются теми, которые могут повлиять на научную целостность содержания. Однако запросы на ретроактивное изменение списка авторов в опубликованных статьях могут быть сделаны в соответствие с нашей политикой изменения списка авторов без каких-либо формальных исправлений. В редких случаях, когда имеется существенная ошибка, требующая исправления принятой рукописи до публикации окончательной версии, будет опубликована вторая версия принятой рукописи. Первая версия будет по-прежнему доступна, а описание исправлений будет включено в виде сноски в PDF-файл новой версии. Описание исправлений также будет добавлено в виде комментария в Интернете. После публикации финальной версии рукописи возможны только официальные корректировки. Официальные корректировки публикуются на сайте СБФ, а предыдущие версии заменяются. СБФ передаст корректировки в соответствующие индексы и репозитории, хотя некоторые могут не принять исправления. Если у вас есть какие-либо сомнения по поводу исправления, пожалуйста, свяжитесь с редакцией.


Апелляции

Если Вы хотите подать апелляцию на решение редакционной коллегии, Вам необходимо обратиться в редакционную коллегию. Пожалуйста, предоставьте официальный ответ с указанием оснований для апелляции и укажите «Апелляция» в строке темы. Также предоставьте подробный ответ, если решение было принято после рецензии. Апелляции будут рассматриваться в случае, если произошла существенная фактическая ошибка, если конкурирующий интерес мог поставить под угрозу объективность процесса рецензирования или когда уже получены новые данные или их анализ, касающиеся основной причины отклонения. При обращении к нам четко укажите причины апелляции. В идеале апелляции следует запрашивать в течение одного месяца с момента получения решения, после чего любую новую версию статьи следует подавать как новую заявку. Апелляции обычно направляются первоначальному редактору. Мы рассмотрим только один запрос на апелляцию по любой отдельной версии заявки.

 

 

Инструкции для авторов были разработаны на основе лучших практик инструкций eLife, PLOS and ICMJ.